不等自然进化了!诺奖得主9460万,赌AlphaFold没走的那条路
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AI BioDesign团队通过大规模并行实验设计自然界不存在的蛋白质,利用DNA测序仪同时分析600万条人工设计序列,传统方法需数年完成的实验在此仅需一次测序。
该项目由保罗·艾伦遗产体系投入9460万美元支持,由2024年诺贝尔化学奖得主David Baker与基因组学家Jay Shendure共同领导,核心是构建AI驱动的闭环系统。
团队采用‘设计-构建-测量-学习’循环,通过劫持细胞生产线同时合成数百万分子,让模型在海量人工设计数据中学习,而非依赖自然进化产物。
2003年Baker团队已成功设计出折叠方式前所未见的Top7蛋白,2024年诺贝尔奖一半授予其蛋白质设计工作,另一半授予AlphaFold结构预测团队。
相比AlphaFold依赖自然数据,该项目重仓实验基础设施,通过合成DNA筛查系统防范潜在风险,计划18个月后开放所有数据与方法。
研究显示合成DNA筛查系统存在漏洞,微软团队测试发现四款软件漏检率高达72种受关注蛋白的合成同源序列,后续通过补丁提升检测效率。
Baker认为AI速度已能匹配合成生物学实验能力,未来目标包括快速开发新疗法、降解海洋塑料及构建低耗能生物计算机,目前仍需突破设计与验证间的效率瓶颈。